Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation Preprint
Article first published online: 01 JUL 2019 | DOI: 10.17581/bp.2019.08203
BIOKEYS software: an introduction for dichotomous keys use
Nguyen Van Sinh
Institute of Ecology and Biological Resources, Vietnam Academy of Science and Technology, Hanoi, Vietnam
The paper is an introduction how to work with dichotomous keys in the BIOKEYS software (http://accountvienst.readyhosting.com/index.asp?prgID=1), including creating of dichotomous data, creating dichotomous key from dichotomous data, specimen identification by using dichotomous keys and illustration of the identification result with data from integrated database. This way of creating dichotomous data with successive creating dichotomous key in BIOKEYS software allows choosing the best version of dichotomous key both in evolutionary and phylogenetic meanings. Because Edicho index allows to quantitatively evaluate performance of a dichotomous key based on the evenness of the number of steps to identification of all taxa, its calculation has been integrated in BIOKEYS software.
Нгуен Ван Шинь. Программа BIOKEYS: введение в использование дихотомических ключей. Эта статья представляет собой введение в работу с дихотомическими ключами в программe BIOKEYS (http://accountvienst.readyhosting.com/index.asp?PrgID=1), и включает в себя создание дихотомических данных, создание дихотомического ключа из этих данных, идентификацию образца с использованием построенных ключeй и иллюстрацию результата идентификации с данными из базы данных. Описанный способ создания дихотомических данных с последовательным созданием дихотомического ключа в программe BIOKEYS позволяет выбрать лучшую версию дихотомического ключа, отражающего как эволюционный, так и филогенетический смысл. Поскольку индекс Edicho позволяет количественно оценить эффективность созданного дихотомического ключa на основе равномерности количества шагов для идентификации всех таксонов, его расчет был интегрирован в программное обеспечение BIOKEYS.
Keywords: software, dichotomous key, BIOKEYS, taxonomy, программа, дихотомический ключ, таксономия
References
Gradstein, S.R. 2018. Key to hornworts (Anthocerotophyta) of Colombia. Caldasia 40(2):262-270. CrossRef
Nguyen, V.S. 2015. BIOKEYS - an integrated system for working with database and polyclave identification keys of various taxonomic levels. Vietnam Journal of Science and Technology 53 (2): 127-138. CrossRef
Nguyen, V.S., M. Wiemers & J. Settele 2017. Proposal for an index to evaluate dichotomous keys. ZooKeys 685: 83-89. CrossRef
Pielou, E.C. 1966. The measurement of diversity in different types of biological collections. Journal of Theoretical Biology 13:131-144. CrossRef
|
|