Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation Preprint
Article first published online: 31 OCT 2018 | DOI: 10.17581/bp.2018.07207
Diderma velutinum, a new species of Diderma (Myxomycetes) with large columella and triple peridium from Russia
Fedor M. Bortnikov1, Oleg N. Shchepin2, Vladimir I. Gmoshinskiy1, Ilya S. Prikhodko2 & Yuri K. Novozhilov2
1 Lomonosov Moscow State University, Faculty of Biology, Mycology and Algology Dept., Moscow 119234 Russia
2 V.L. Komarov Botanical Institute RAS, Saint-Petersburg, Russia
A new species, Diderma velutinum, is described and illustrated by LM and SEM micrographs. Two specimens of this species were found in moist chamber cultures on the pieces of the bark of living tree of Phellodendron amurense, which was collected in July 2016 and July 2017 in the Kedrovaya Pad State Nature Biosphere Reserve (the Russian Far East). The main distinguishing features of this species are triple peridium, large spherical columella and ochraceous colour of sporangia clustered in dense groups. The partial 18S rRNA gene sequences of D. velutinum differ considerably from all sequences of Diderma species available to the moment.
Бортников Ф.М., Щепин О.Н., Гмошинский В.И., Приходько И.С., Новожилов Ю.К. Diderma velutinum, новый вид рода Diderma (Myxomycetes) с большой колонкой и трехслойным перидием из России. Новый вид Diderma velutinum описан и проиллюстрирован микрофотографиями, полученными с помощью светового и сканирующего электронного микроскопов. Два образца этого вида были получены методом влажных камер на фрагментах коры живого дерева бархата амурского (Phellodendron amurense), собранных в июле 2016 и июле 2017 года в государственном природном биосферном заповеднике «Кедровая Падь» (Приморский Край). Основными отличительными особенностями этого вида являются трехслойный перидий, большая сферическая колонка и охристая окраска спорангиев, собранных в плотные группы. Нуклеотидные последовательности фрагмента гена 18S рРНК нового вида показывают значительные отличия от имеющихся последовательностей других видов рода Diderma.
Keywords: Amoebozoa, COI, DNA barcoding, EF1A, morphology, Physarales, SEM, taxonomy, 18S rRNA, ДНК-баркодинг, морфология, СЭМ, таксономия, 18S рРНК
References
Anonymous 2012. NBS/ISCC Colour System. Original and Improved 267 Colour Centroids. Washington, Inter-Society Colour Council. National Bureau of Standards. http://tx4.us/nbsiscc.htm (accessed July 2018).
Bezerra, A.C.C. & L.D.H. Cavalcanti 2010. Diderma albocolumella (Myxomycetes), a new species in the Brazilian Atlantic Forest. Rodriguésia 61(1):105–108. CrossRef
Borg Dahl, M., A.D. Brejnrod, M. Unterseher, T. Hoppe, Y. Feng, Y.K. Novozhilov, S.J. Sørensen & M. Schnittler 2017. Genetic barcoding of dark-spored myxomycetes (Amoebozoa) – identification, evaluation and application of a sequence similarity threshold for species differentiation in NGS studies. Molecular Ecology Resources 18(2):306–318. CrossRef
Lado, C. 2005–2018. An on line nomenclatural information system of Eumycetozoa. Real Jardin Botanico, CSIC. Madrid, Spain. http://www.nomen.eumycetozoa.com (accessed July 2018).
Martin, G.W. & C.J. Alexopoulos 1969. The Myxomycetes. University of Iowa Press, Iowa City, 561 pp. Moreno, G., Á. López-Villalba, S.L. Stephenson & A. Castillo 2018. Lepidoderma cristatosporum, a new species of myxomycete from Australia. Mycoscience 59(5):386–391. CrossRef
Rognes, T., T. Flouri, B. Nichols, C. Quince & F. Mahé 2016. VSEARCH: a versatile open source tool for metagenomics. PeerJ 4:e2584. CrossRef
Schnittler, M., M. Unterseher, T. Pfeiffer, Yu. K. Novozhilov & A.M. Fiore-Donno 2010. Ecology of sandstone ravine myxomycetes from Saxonian Switzerland (Germany). Nova Hedwigia 90(3–4):277–302. CrossRef
Schnittler, M., O.N. Shchepin, N.H.A. Dagamac, M. Borg Dahl & Y. K. Novozhilov 2017. Barcoding myxomycetes with molecular markers: challenges and opportunities. Nova Hedwigia 104(1–3):323–341. CrossRef
Shchepin, O.N., Y.K. Novozhilov & M. Schnittler 2016. Disentangling the taxonomic structure of the Lepidoderma chailletii-carestianum species complex (Myxogastria, Amoebozoa): genetic and morphological aspects. Protistology 10(4):117–129. CrossRef
Yamamoto, Y. & N.E. Nannenga-Bremekamp 1995. Diderma ochraceum var. izawae, a new Myxomycete from New Zealand. Proceedings of the Royal Netherlands Academy of Arts and Sciences 3(98):327–328.
|
|